Científicos publican el primer genoma de referencia de tilapia cultivada

Recientemente se publicó el genoma de referencia para una cepa de tilapia mejorada genéticamente gracias a la colaboración entre el Instituto Earlham, el Instituto Roslin y WorldFish, que encabeza el programa de investigación FISH del CGIAR, un consorcio de centros de investigación cuya labor es aumentar la seguridad alimentaria.

Este logro científico tiene el potencial de mejorar la seguridad alimentaria de una gran cantidad de personas que sufren escasez de alimentos ya que permite a los criadores de peces desarrollar cepas que cultivan peces más grandes más rápido y con una mayor resistencia al calentamiento global.

 

Un genoma de referencia proporciona un catálogo completo y anotado de todos los genes en un organismo. Este recurso crucial es la base de los programas modernos de mejoramiento”, explicó Wilfried Haerty, autor del estudio y líder del grupo en el Instituto Earlham.

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El genoma modificado de la tilapia

El genoma revela datos relevantes acerca de la variabilidad genética en las cepas de tilapia que se cultivan. La demanda global de peces ocasionó que algunos se encuentren en peligro de extinción o en estado de amenaza. No obstante, la proteína que se extrae de estos es crucial para la nutrición de millones de personas en todo el mundo.

Con la creciente demanda de pescado, la acuicultura experimentó un auge en los últimos 25 años. Sin embargo, su producción actualmente rivaliza con la captura de peces salvajes.

La tilapia del Nilo (Oreochromis niloticus) es uno de los peces más populares en la acuicultura a nivel mundial y su éxito se debe en gran medida a la cría selectiva de cepas que pueden crecer y aumentar de peso de forma rápida.

La cepa de Tilapia Cultivada Genéticamente Mejorada (GIFT por sus siglas en inglés), en particular, ha permitido a los criadores de peces desarrollar cepas que alcanzan un mayor tamaño. Se estima que para 2050 la demanda de alimentos (incluidas las proteínas animales) aumentará de 36 a un 51% como resultado de la reducción de la calidad de la tierra y las fuentes de agua.

La importancia de cepa GIFT

La cepa GIFT representa la primera población de tilapia del Nilo que ha sido mejorada genéticamente mediante la cría selectiva enfocada en la supervivencia y la aceleración del crecimiento. Debido a esto, pudo ser distribuida en al menos 14 países en los cinco continentes.

Mediante la utilización de las lecturas largas de PacBio HiFi (secuenciación que proporciona la información genómica y epigenómica más precisa), los investigadores lograron identificar un incremento en el contenido del genoma de casi 50Mb entre el ensamblaje y el genoma de referencia de O. niloticus.

Aunque una proporción considerable de esta diferencia podría ser atribuida a variaciones tecnológicas, algunas de estas discrepancias también podrían reflejar la variabilidad genómica entre las diferentes cepas que fueron secuenciadas.

Con el fin de seguir avanzando en el desarrollo de la cepa y permitir su mejora en el futuro, diversos estudios se han enfocado en investigar las bases genéticas que subyacen a los rasgos de interés económico.

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